多數有機碳是在生物圈中持續循環-的地質微生物
化石燃料的地質微生物學
盡管多數有機碳是在生物圈中持續循環的，而有很大一部分卻被束
縛在特定的沉積結構中，這種情況下的有機物將無法被微生物礦化，直
至因自然或者人為因素重新暴露在水中。同時，對空氣的需求依賴于這
些碳元素所遇到的微生物，以及氧氣以外這些微生物能夠利用的電子受
體。受限制的有機碳存在形式多樣。其化學還原程度與受限制的時間長
短有關，也和該過程中的其他變化相關。這類碳化合物的部分形態可以
作為工業及其他人類活動的燃料和能源，從而被開發利用。由于這些物
質年代久遠遂被稱為化石燃料。這些受限碳化合物的殘余物質主要是油
源和瀝青，可被人類轉化成燃料�；剂习淄闅狻⑻烊粴�(主要
是甲烷)、石油、油頁巖、煤炭和泥煤。通常認為它們的起源與生物相關
化石燃料的天然富集
地球表面碳化合物的主要形式為碳酸鹽。這是一個主要的碳元素聚
集形式，其他形式則是無法被微生物直接礦化的有機碳化合物。碳酸鹽
不是碳的絕對聚集形式，除非深埋在地下，因為它與溶解態的碳酸鹽／
重碳酸鹽以及空氣中的二氧化碳有關，而這些化合物都與活的或死亡的
生物中的有機碳有密切的關系。碳元素從一種形式轉化到另一種形式的
途徑是受生物控制的
