細胞聚合物-微生物對碳酸鈣形式的沉淀積累
微生物對碳酸鈣形式的沉淀積累也有重要作用，例如來自于顆石藻
化石或有孔蟲類，硅藻中的二氧化硅硅藻細胞，在海洋湖泊中，硅的作
用例如來自于放射蟲和輻足綱動物。微生物的風化作用和／或者微生物
從不完整的有機物質再生出有機碎片的活動會影響到湖泊的壽命。
微生物不能發揮作用的地質活動有巖漿活動或火山活動，由于熱和
壓力的作用導致的巖石變質，地殼形成和轉換的構造活動，造山運動的
同源過程。還包括風和水的侵蝕活動，盡管這些活動會因為先前的或正
在進行的微生物的風化作用而變得容易，但是微生物在這些方面作用不
顯著。盡管微生物不能影響以上地質活動，但以上地質活動會影響微生
物，因為這些活動會創造出新的環境，和這些地質活動發生之前相比，
這些新的環境會變得適宜或者不適宜微生物的生長。
微生物地質活動過程中作為催化劑的微生物
絕大多數微生物對地質作用的影響是建立在生理學基礎上的。微生
物還可能在地質化學活動中起催化劑的作用，或者，微生物是地質化學
過程中活躍物質的生產者或者消費者，地質化學反應中某些物質是微生
物代謝的反應物或者產物，因此微生物會影響地質化學反應速率。上述
兩種情況都是通過代謝實現的，這個代謝過程包括兩個組分，一個是通
過獲取能量為細胞提供必要能量的分解代謝，在這個過程中也會產生對
細胞建造聚合物有用的復合物。獲取能量過程的一個重要反應是合適代
謝物(從營養中代謝之后得到)的氧化。代謝的另一組分是合成代謝，它
與同化(合成反應，聚合作用)有關，合成代謝使細胞合成有機聚合物，
例如核酸、蛋白質、多聚糖、脂類等等。合成代謝與無機聚合物也有關
，例如硅藻細胞和放射蟲中的聚合硅以及一些細菌和酵母菌作為能量儲
存物而合成的多聚磷酸鹽顆粒。合成代謝能夠增加細胞質量，復制重要
分子，使細胞生長和復制成為可能。分解代謝和合成代謝互相聯系不可
分割，分解代謝為合成代謝提供能量和必要的代謝物，而合成代謝是需
要能量的。分解代謝和合成代謝都對地質活動有所影響。例如，合成代
謝利用化石燃料(泥炭、煤和石油)所產生的物質合成有機復合物。硅藻
細胞和放線蟲就是通過上述途徑積累硅質軟泥的。
