在光學顯微鏡觀察下鑒定和計量地球微生物
地球微生物學非分子學方法
地質微生物活動可以進行現場研究，也可以在實驗室作為系統
或離體反應進行研究。一種地球微生物現象的現場研究應包括鑒定
和計量地球微生物的活性物質，并在現場環境中測定它們的平均生
長速率，還包括反應中問產物(包括不溶的礦物顆粒和可溶的有機
或無機底物)物理和化學鑒定底物，還包括測定總的反應速率，評
估不同的環境因素對反應速率的影響。然而實際上，有的可能在較
早的地質時期發生過的地質微生物過程在現有環境條件不會再發生
了。在這種情況下，這些過程中微生物的作用需在顯微鏡觀察下重
建(例如，尋找與起始物有關微生物化石，尤其是找到過程中反應
產物的微生物化石)也可以改為地質化學法觀察，比如在沉積的巖
石樣品中尋找標志化合物。這種巖石樣品可以表明過去存在與生物
標志化合物相關的一種微生物或一群微生物。如果可行，尋找一種
涉及地球微生物過程關鍵因子的同位素也是非常重要的。
考察一個正在進行的地球微生物過程需研究其所在的自然環境
，在陸地環境中包括研究巖石、土壤或泥沙的質地、礦物質成分、
當時的溫度、pH、氧化還原電位(Eh)、光照強度、季節循環、可利
用的水分、氧氣或其他終電子受體和養分。在水環境中，包括研究
水深度、可利用的氧氣或其他終電子受體、渾濁度、透光條件、熱
力分層、pH、Eh、水中化學物質成分，還需要考慮沉降層的性質包
括產地、養分資源和可獲得性等。
