瓊脂糖凝膠魚類堅定DNA技術分析圖像顯微鏡
用于魚種鑒定的DNA技術
對于不能用現有方法鑒定的魚種,DNA技術的應用令人感興趣。與
蛋白質一樣,DNA也會因加熱而降解,但目前已有技術從降解片段中分
離出具有種類特異性的片段,該方法較根本的是聚合酶鏈反應(PCR)。P
CR能使DNA上種類特異性序列成為目標并被放大,目前大部分研究集中
在線粒體的DNA的細胞色素B基因上,因為特別是對于魚,有很多序列可
用于比較,比如金槍魚,已經進行了廣泛的種系發生研究。DNA探針依
賴于探針序列與目標DNA片段序列之間的特異性反應。當隨后的瓊脂膠
電泳分離時,就能鑒定和分離DNA產物,供其他技術進一步分析。核苷
酸殘基序列可以用計算機數據庫測定與比較,或者用具有特異性的酶(
內切酶)降解。降解的DNA可用瓊脂糖凝膠電泳分離,再在紫外光下檢測
可得到一組具有熒光的譜帶,只要所用的酶合適,這些譜帶與蛋白譜帶
一樣,具有種類特異性。DNA技術的一個很大的優點是盡管由于罐藏加
工使DNA發生很大的降解,但仍有通過引物可辨認的足夠材料。然而,
眾所周知,在商業操作中加熱程度有相當大的差異,
而且通常會殺菌過度,因此評價鑒定罐裝魚品種的DNA技術必須考
慮這些系數。還有,也應當考慮魚在宰后及罐裝前的情況,因為在冰藏
和冷凍貯藏時,已知DNA會發生一定程度的降解。
從罐裝金槍魚和原料金槍魚中分離得到的DNA的典型電泳圖。從所
有罐裝樣品中分離出的DNA都嚴重降解,僅有100對堿基殘基。通過選擇
對已知順序的細胞色素B線粒體基因,有特異性的引物,有可能在7種具
有重要商業意義的罐頭中分離到足量的PCR產物并得到它們的序列。通
過參考堿基數據庫,可從它們的特定序列中鑒定出每一品種。然而,由
于罐裝前金槍魚的貯藏條件和罐藏熱處理條件有很大的差異性,因此,
該方法在商品化罐藏制品方面還需要證實。
目前也已經研究了限制性酶的應用,并且根據電泳得到的分離圖譜
已經確切證實了這種簡單的方法可被用于罐裝金槍魚和鰹魚的常規物種
類鑒定