油藏微生物不同的培養溫度獲得了不同培養物。
不同的培養溫度獲得了不同的培養物。有趣的是，作者通過16S rR
NA基因序列分析，發現巖心樣品中的微生物群落與鉆井泥漿中的微
生物類型完全不同，表明巖心中發現的微生物具有油藏內源微生物
的潛質。
然而，大多數用于微生物研究的樣品都取自于采油設備的產出
液體。油層采出水一般取自于儲油罐、分離器和集輸管線，故大部
分采集的樣品并不是典型的油藏流體樣品，因為這些設備很容易受
微生物污染。生物膜生長于設備表面，在水中釋放出與油田內源微
生物無關的微生物，因此，采集油層采出水時應盡量采集井口的樣
品。若油井選擇恰當，采集的采出液來自于單一地層的單一采油區
，采出液將不會受到其他不同地化性質的油藏微生物的污染。采集
樣品時應當避免被污染，由于油藏是一個厭氧生態系統，樣品應避
免暴露于空氣中。由此可知，取樣前應先準備無氧無菌的容器，將
采樣設備消毒滅菌，除去殘留液。但即使如此，長達幾百米甚至幾
千米的油井生產管柱也容易形成生物膜而污染采出液。這些微生物
并不是全部來自于地層水，而部分是來自于井筒管柱。油井中硫酸
鹽還原菌的生長，造成了所謂的油井酸化現象，證實了油井管柱本
身就是一個獨特的生態系統。
微生物進入油藏的另一個途徑是注水開采，無論注入水的來源
是什么，包括油層采出水的二次注入都會對油藏造成污染。因此，
研究真正的內源微生物應選擇未被注水開發的油藏。
由于改進的鉆井技術并未考慮用于油藏微生物的研究，因此這
些樣品并不能完全反映地層環境。微生物學家只能推斷分離自這些
樣品中的特殊微生物的潛在內源特性。
