凝膠的特征-瓊脂糖是從海藻中提取的多糖
電泳法分離核酸
電泳法在分離和純化生物大分子方面應用廣泛,尤其是蛋白質
和核酸方面的應用。這些帶電物質的分離,是因為在直流電場下它
們在緩沖液中具有不同的遷移速率。由于核酸分子的磷酸骨架帶有
負電荷,所以在電泳過程中核酸會向正極移動;另外蛋白質為兩性
物質,根據其帶電性質可確定其遷移方向。
凝膠電泳法提純核酸
凝膠電泳可通過DNA的大小將其分離二凝膠中加入DNA片段后在
凝膠兩端施加電位,因為DNA分子帶負電,它會向正極移動;而受
到凝膠基質的阻礙,較大的片段移動減慢,較小的片段則移動較快
。帶有阻力的凝膠相當于分子篩,從而依據片段大小將其分離,大
分子遷移率取決于凝膠聚合強度、分子大小和形狀以及緩沖液的離
子強度和溫度。染色后,分離的大分子會在凝膠上顯示為從一端到
另一端的一系列條帶。
凝膠電泳分離法較常用的瓊脂糖凝膠電泳.帶眼井的凝膠薄板
可以作為樣品的載體,它浸沒在一定pH值和離子強度的緩沖液中。
用染色劑(如5μm/mL EB)進行染色,可通過觀察熒光來檢測DNA。
電泳后向DNA樣本中加入載體染料,相當于將DNA標記;染料中也含
有甘油和蔗糖,可將提高樣本的密度,使其沉淀到凝膠的井底?常
用的兩種凝膠為瓊脂糖和聚丙烯酰胺。
凝膠的特性
瓊脂糖是一種從海藻中提取的平均分子量為12000的線性多糖
,它由瓊脂的重復單位組成,由半乳糖和3,6一葡萄糖分子交替構
成。瓊脂糖所用的濃度一般在0.5%~3%之間、瓊脂糖凝膠是將
粉末狀的瓊脂糖凝膠溶解于緩沖液中煮沸后形成無色溶液,冷卻后
倒出形成凝膠塊,瓊脂糖凝膠塊易碎,操作時應小心,避免其被破
壞二瓊脂糖濃度越高,凝膠塊就越硬,形成的孔徑就越小。大分
子的電泳遷移率與其能通過孔徑的體積分數成正比。加入適當濃
度的瓊脂糖,施加合適的電場,可分離長度在200~50000bp范圍內
的DNA片段;應用脈沖場凝膠電泳(電泳槽中電流方向周期性變化)
可以分離50000~5000000bp的超大片段核酸。瓊脂糖凝膠電泳比聚
丙烯酰胺凝膠電泳速度快,然而前者因為孔徑較大,所以分離能
力較后者低.在一定的瓊脂糖濃度下,待檢測的DNA片段遷移率與D
NA片段長度(bp)的對數呈線性關系