葡萄糖為主的基質的實驗室微生物分析顯微鏡
溫度
該參數經常保持常數，或至少試圖保持常數，因此不用做操縱
變量。氨抑制中溫度影響的研究揭示降低溫度可能減少抑制作用。
因此，作為操縱變量的溫度原則上能用于處理氨濃度的快速上升。
然而，快速溫度改變導致短期內降解上巨大的下降，而且僅有很少
的嘗試是以控制為目的的使用溫度。作為操縱變量使用溫度要求能
用簡單的方法評估改變的效果。因為溫度影響生物和化學反應，從
溫度變化中能預期沒有簡單的輸出。溫度控制必須集中在發現較優
溫度而不是持續改變它。已試驗了用甲烷產率評估溫度變化。該試
驗在處理葡萄糖為主的基質的實驗室反應器系統上進行，發現起始
溫度為30℃時較優培養條件是47．5℃。該例子中廢棄物易于降解
而且可以預期甲烷產生是轉化為甲烷的過程中的瓶頸。
很多厭氧裝置建造時有限定的比熱容，不容易實現大范圍內的
溫度控制。結果是，大多數溫度控制集中在穩定溫度環境，有時利
用進料溫度的前饋控制反應器溫度。
厭氧消化過程的復雜性和敏感性迫使使用高效控制策略。厭氧
消化控制的興趣點是滿足過程穩定性和較大化產率的需求。然而，
這兩個目標常相互沖突而且為完成這個任務控制器必須高度精巧。
通常，控制器的復雜度隨其設計目標的多樣性而增長。由此，文獻
中找得到的該研究領域的工作從簡單控制到更復雜的自適應控制器
或人工智能控制(如模糊、知識庫和神經網絡控制器)。
