植物代謝物可分為初級代謝物和次級代謝物兩種
植物代謝物可分為初級代謝物和次級代謝物兩種。初級代謝物
是指生物生長、發育和繁殖所必需的代謝物；次級代謝物則不直接
參與上述過程，但有其重要的生態學功能，可在自然防御機制(如
抵抗昆蟲寄生和真菌感染)和吸引傳粉者方面發揮作用。制藥、化
妝品和營養食品工業通常使用次級代謝物，生物質能源產業則多使
用初級代謝物，如利用單糖、寡糖、淀粉、纖維素和半纖維素進行
能源生產。但是，次級代謝物可以使生物質的價值提升，從而更好
地為人類服務。
通常來說，初級代謝物占代謝物總量的比例較大，而次級代謝
物的量較少。當有誘導物存在，或受環境因素影響，以及受食草動
物和昆蟲等生物體脅迫時，植物次級代謝物產量可能會增加。不同
代謝物組分的分布隨代謝物的功能和植物所處季節的不同而不同，
如淀粉等儲藏性物質主要在根、莖和種子中積累，次級代謝物多存
在于作為防御環境影響第一屏障的植物器官中，如樹皮等。
對初級代謝物和次級代謝物進行簡要概述，并按結構和碳數對
代謝物進行分類。當某一類化合物并非普遍存在時，首先對該類化
合物進行系統生物學概述，并預測在哪一類生物體中可發現它。
