工業微生物真菌、酵母菌和絲狀細菌分析顯微鏡
工業微生物另一個重要的前提條件是能從培養基中相對容易地
除去微生物細胞。在實驗室中主要通過離心從培養基中除去細胞，
但離心對于大規模生產可能是困難而昂貴的。較合適的工業微生物
是那些個體較大的細胞，因為較大的細胞能很快地從培養基中沉淀
下來或能用相對便宜的過濾物質較容易地濾出，真菌、酵母菌和絲
狀細菌是很合適的。由于單細胞細菌個體較小，所以很難從培養液
中從分離出來。
較后一個特點是工業微生物能夠進行基因操作。在工業微生物
學中，提高產量主要通過突變和篩選的遺傳方法獲得。不論是通過
有性還是準性過程，工業微生物也能夠進行基因重組，基因重組是
把不同生物的基因特征整合到一個基因組內。但是，許多工業菌株
沒有發生任何基因重組，只是通過突變和篩選就已發生了很大的改
變。工業產物
有工業價值的微生物產物有幾種主要類型，其中包括微生物細
胞本身，例如，培養酵母用于食品，面包發酵和釀造(圖及細胞產
物，后者包括酶，如葡萄糖異構酶，藥理活性劑，如抗生素，類固
醇和生物堿，特殊化學藥品和食品添加劑，如目前流行的天冬苯丙
二肽酯食物和甜飲料，通用化學藥品，如乙醇
