大多數植物陸地生長具內含葉綠素的—葉綠體。
真菌界
真菌界主要是多細胞生物，也有一些是單細胞生物。真菌僅僅
依靠從生物尸體攝取有機物來獲取養分。甚至當它們入侵活組織時
，真菌經常是殺死細胞，然后從死細胞中汲取營養。盡管真菌與植
物有某些共同特征，但它們在結構上要比植物真正的葉子或莖簡單
得多。真菌生成孢子，但并不形成種子。許多真菌對于其他生物的
生存并不構成威脅，但也有一些會襲擊植物、動物，甚至人類。另
外，酵母菌和蘑菇可作為食物，或在食品生產中起著重要作
用。
植物界
因為已將大多數顯微真核生物劃入原生生物界，所以，植物界
(Plantae)中僅留下了肉眼可見的綠色植物。大多數植物陸地生長
，具內含葉綠素的細胞器——葉綠體。令微生物學家感興趣的是植
物含有某些藥用物質，如金雞納堿，它們可以被用來治療微生物感
染。許多微生物學家對植物與微生物相互關系非常有興趣，特別是
植物病原體，因為它們正威脅著食物供應。
動物界
動物界(Animalia)包括所有從合子(合子是由兩個配子結合而
成，如一個精子和一個卵細胞)發育而來的動物。盡管動物界中幾
乎所有成員都是肉眼可見，對于微生物學家來說似乎沒有什么意義
，但還有某些動物種群生活在其他生物體內或體表，也有些作為微
生物的載體。
