細胞顯微鏡-脂類、碳水化合物、代謝產物和溶質
高等生物中，轉錄過程中所產生前期轉錄物可能會受到進一步的加
工和修飾，其內部一些特殊的序列——內含子，會被從前期轉錄物
中刪除掉，這時的RNA分子才成為實際的信使RNA。在翻譯過程中，
有些遺傳信息會進一步的丟失和變得模糊，這就會產生以下幾種結
果。
①就像在轉錄過程中所看到的，只有一部分mRNA被翻譯成蛋白
質，被翻譯的區域稱為閱讀框。
②3個mRNA核苷酸堿基的框架結構(密碼子)才能編碼一個氨基
酸。共有4種核苷酸堿基，從中任意取出3個，就可以有64種不同的
組合，然而，只有20種氨基酸參與蛋白的合成。有些密碼子編碼同
一種氨基酸，實際上，絲氨酸、亮氨酸和精氨酸這3個氨基酸都可
以由6個不同的密碼子所編碼。只有甲硫氨酸和色氨酸是由一種密
碼子所編碼的，因此，一個蛋白質的氨基酸序列只有部分適用于推
測mRNA的核苷酸序列。
③許多種蛋白質還要進行翻譯后加工，加工的結果是一部分肽
鏈被除去了。很顯然，從成熟的蛋白肽鏈中無法推測出除去肽鏈部
分的相關mRNA或DNA的任何信息。
對RNA和蛋白質的序列分析仍能夠獲得一部分有關DNA序列的相
關信息，但對其他細胞成分(脂類、碳水化合物、代謝產物和溶質)
以及表型的分析研究卻不能提供任何有關DNA序列的線索。正如上
面所指出的那樣，這些檢測結果可以證實遺傳變異確實存在，然而
，有關變異發生的真實情況卻無法知曉。
因此，要確定基因工程變異是否真實的發生，一個理想的目標
分子就是DNA分子本身。事實也確實如此，因為較敏感、較快和強
有力的DNA檢測方法已經成為現實。進一步講，引入一種生物有機
體DNA中的外源基因只能在DNA水平上才能被毫無疑義確定下來。例
如，一種細菌酶出現在一種植物的提取液中，那么這很有可能是受
到污染的結果；只要這種酶沒有經過翻譯后加工，還如同在細菌一
樣，它究竟是在植物中表達的還是源自細菌，蛋白質自身不能提供
任何相關信息。然而，相應的基因，需克隆在一個載體結構中，經
過植物
轉化途徑，較后整合進入植物的染色體中，這些都有助于鑒定這個
外源基因，因為該基因兩端的序列在自然情況下并不出現在這個基
因的兩側。因此，專門檢測兩個不同來源DNA核苷酸序列的融合位
點就會發現它是否屬于一個基因工程產物：這種獨特的DNA序列僅
出現在特殊的DNA重組結構中而不會出現在別的什么地方。
