可用高速計算機來分析分子的電子密度的三維圖形
利用這些以及類似的技術，或單獨使用，或結合使用，就可以測出
很多蛋白質的分子量及其大致的形狀。然而這種形狀只不過是近似的，
用這些技術并不能得到所有的原子空間分布的真正指征。只有x射線衍
射分析可以測定出詳細結構。X射線被電子所散射，其散射程度與分子
中任何點電子密度成正比。
為了能測定x射線散射并避免相鄰分子的散射干擾，分子必須是在
空間排列的。結晶體就是分子的有序排列，所以用這種技術測定蛋白質
結構的先決條件就是要使蛋白質結晶。這件事常常并不是容易的，要長
成大小和結構都滿意的結晶，可能要花好幾年的時間。通常蛋白質的金
屬衍生物都是結晶化的，因為金屬是很好的x射線散射中心，它將為其
他可能與電子密度有關的分子提供一個參考點。從x射線被蛋白質晶體
的散射而得到的衍射照像的詳細情況，可用高速電子計算機來分析，用
這種方法，建立起了一種分子的電子密度的三維圖形�？梢詼y得0．2毫
微米的蛋白質分辨率。肽鍵各原子之間相距大約就是這個距離。蛋白質
鏈上相鄰部分的原子互相可接近到約0．3毫微米。這就給出了在這種分
辨率下可以得到的結構細節的指征。遺憾的是，這種技術是既費錢又費
工，而且也很難得到滿意的結晶，所以目前只限于在相當少數幾種蛋白
質中應用。
