普通光學顯微鏡觀察樣本的解析度為0.2微米
雖然光學技術解析度不若電子顯微鏡或是 STM,但是電子顯微鏡的樣本需要經過繁複的處理手續且幾乎都是在真空中方能觀測,STM 則只能觀察表面原子的結構。光學顯微技術可以提供的主要優勢之一在于非破壞性的檢測,樣本準備非常容易,這點對于需要觀察活體細胞組織的生物醫學應用格外重要。
而且一般細胞對光而言相對透明,因此光學技術能夠提供數釐米的穿透深度。
若從醫學影像角度來看,大概就屬核磁共振造影、電腦斷層造影、和超音波成像發展的較為成功,但是它們的解
析度一般都在毫米等級。而光學技術則可達到微米級解析度,提供了細胞甚至分子尺度上的訊息。
另一項光學顯微技術的主要優點就是有多種對比可供選擇,例如傳統的顯微技術多是以吸收量的差異來成像,
但若要觀察接近透明的樣本時,樣本上吸收量和環境的差異就非常小,此時就可以靠相位差異來提供對比
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