電子顯微鏡觀察可以觀察到染色的披衣菌的基體

目前對披衣菌的分離仍然以6~8日齡的雞胚胎內卵黃曩內的分離較成功。

一般是將處理過的樣品約0.2ml，

以注射針直接的接種到雞胚胎的卵黃曩內，然后將雞胚胎放在37℃的恒溫箱內培養，經培養4~6日后可能雞胚胎會死亡，

如果第一次接種的雞胚胎觀察7天后未死，則將雞胚胎收集冷藏后抽取卵黃曩液經2至3代的培養后雞胚胎才會
因有感染型的披衣菌增殖而造成雞胚胎死亡。我們可以收集死亡雞胚胎的卵黃曩液及卵黃曩膜，

以電子顯微鏡觀察卵黃曩內是否有披衣菌的基體�；蚴菍⒙腰S曩膜攤開，有時可以發現膜上會有披衣菌增殖的病灶斑點。
而將收集的卵黃曩膜剪粹和研磨后所收集的液態進行電子顯微鏡觀察或是用Giemsa染色可以觀察到披衣菌的基體。

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