顯微鏡直接測數法-土壤中微生物的分布狀況
土壤微生物學
土壤微生物學的主要對象或因子，是土壤環境（即條件因子或環境因子）下能活之微生物。站在微生物學之立場，土壤微生物學是研究各種土壤微生物，類似微生物學的各論及生態學；而站在土壤學之立場，土壤微生物學是多種微生物生長于混合固體基質（即土壤），似一種生化反應器（土壤環境）內固體酦酵之研究。
研究土壤微生物學的方法可歸納如下：
一、一般土壤中微生物之分布狀況瞭解：通�？捎娠@微鏡直接測數法、玻片埋土法、培養法、測微生物特定成分或測其產物（例如土壤酵素、土壤呼吸力）等來探討。
二、特定微生物：有關特定微生物，可用強化培養法（Enrichment Culture）來分離及測定其數與活性。
三、土壤基質性質之探討：例如土壤保水力（Water Holding Capacity 即WHC）與土壤水分之比例，決定土壤好氣或嫌氣情況、溶解性養分量及適當濕度環境，而影響了微生物之分佈與數量。
首先考慮條件因子中土壤基質（包括土壤物理、化學性質、栽培作物等）對微生物之影響：土壤物理性質有：土壤之質地、構造、空氣、水分、溫度、顏色等；土壤化學有：土壤膠體、PH（土壤反應）、酸度、鹽度、堿度，以及氮、磷、鉀與微量元素等。上述土壤物理、化學性質對微生物之影響，可舉一例說明之。當土壤水分達保水力的三分之二至二分之一時，土壤通氣良好，適合大部分微生物生長。又如浸水土壤中嫌氣性硫酸還原菌、乾旱土壤中真菌、放線菌活動較多。作物為土壤環境因子之一，對微生物具有甚大的影響，所以根圈土壤含有較多之胺基酸，而普通土壤有較多的維生素，所以根圈土壤之微生物相是特別的。荳科植物有根瘤，而所謂可節省氮肥的肥料木（如赤楊木）之根也有根瘤，但其并不是根瘤菌（Rhizobium），而是其他微生物。真菌寄生的樹根稱為菌根（Mycorrhiza），在此有共生作用。氣候條件也是土壤環境條件之一，例如水田含有光合作用的藍綠藻，在陰光下滯留的土壤水中，含有Rhodopseudo Monas類之光合細菌。
其次考慮土壤微生物活動對土壤肥力之影響：此部分范圍甚廣，如碳、氮、磷、鐵等循環，以及其他礦物元素之轉變、腐植質之生成、固氮作用、脫氮作用、硝化作用、溶解化作用。例如異營性微生物為碳循環中的主要分解者，光合成微生物可增加土壤有機物及肥力，在好氣環境下Azotobacter、Spirillum、Rhizobium等可固定空氣中之氮，而增加土壤氮素，在水田嫌氣環境下, Clostridium也可進行固氮作用，但很慢。連作時，根圈附近強化（Enrich）了病害菌，使病害菌聚積，對作物產生病害。
