1. 雖然大部分的真菌繁殖方式包含有性與無性生殖二種，不過通常有性生殖比較重要，因為它能產生數量龐大的后代。
2. 不論生殖是有性還是無性的，在真菌的生命周期中，單倍體階段是主要的生命階段，菌體里面的細胞核是單倍體。
3. 真菌的無性生殖有三種：第一種、塊裂繁殖(fragmentation)—真菌一部分的身體斷裂出來，長成新的個體；
4. 第二種、出芽繁殖(budding)—從母細胞長出小芽，小芽與母體分離，長成新的個體；
5. 第三種、這是較常見的無性生殖，真菌長出孢子spores，每個孢子長成新的個體。
6. 有時候這些孢子長在菌絲的頂端或側邊，而不是孢子囊里面；這種方式長出來的孢子稱為分生孢子conidia。特定菌絲的尾端的成串孢子，會一一長成新的個體。
7. 真菌的有性生殖是非常複雜的，有三個基本階段(1)從2個不同細胞而來的細胞核，進入同一個細胞中，形成一個有2個核的細胞two-nucleate cell。(2)2個單倍體的核nuclei 融合成1個雙倍體的接合子zygote；(3)接合子進行減數分裂，真菌又回到單倍體的狀態。
8. 不同種類的真菌，這三個階段的時間與長度不同，有性生殖組織也不同(也可能缺乏有性生殖組織)。事實上，有性生殖組織是分類的基礎。
