細胞質中有兩個重要的細胞器官(胞器),粒腺體和葉綠體。粒腺體存在動物和植物細胞之中,粒腺體為一個具有兩層雙層磷脂膜的胞器,在它的內膜上有ATP合成腜;粒腺體制造大量ATP分子 - 一種高能分子,細胞的能量來源,因此他可以說是細胞的發電廠。葉綠體則是植物細胞特有的胞器;
它也是一種具有兩層雙層磷脂膜的胞器。葉綠體的內膜折疊形成葉綠餅,在這些餅上具有特殊的酵素,光合作用便在此進行。光合作用會產生兩種高能分子 - ATP 和 NADPH ,這些高能分子會被運送至葉綠體的基質(葉綠體內膜空腔)進行故氮反應合成葡萄糖。
光合作用需要光(紅光),所以這部份的化學反應被稱作光反應;而合成葡萄糖的化學作用則是暗反應
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