首先來說說共聚焦顯微鏡的優點有哪些：比傳統的光學顯微鏡，包括控制景深，消除圖像有辱人格的焦信息，和串行光切片厚標本的收集能力，。共聚焦方法的關鍵是使用空間濾波，以消除的集中光線或耀斑比焦平面厚的標本。

可以從標本準備傳統的光學顯微鏡獲得極高質量的圖像，并在其大量的應用在許多目前的研究興趣的領域。

激光掃描共聚焦顯微鏡模擬器 - 在過去的十年也許是光學顯微鏡的較重大的進步一直是主流激光掃描共聚焦顯微鏡（LSCM）技術，使用改進的熒光探針的合成和基因工程蛋白的細化，再加上廣泛的激光光源高度精確的聲光可調諧濾波器控制，并結合現代高性能計算機更先進的軟件包。

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